维普查重系统在保护用户隐私方面采取了多重措施。首先，用户上传的文档在进行查重前会被自动加密处理，确保文档内容不会被泄露。其次，系统会对用户信息进行匿名化处理，避免个人信息被泄露。此外，维普查重系统严格遵守相关法律法规，保障用户隐私安全。

除了加密处理和匿名化处理外，维普查重系统还会定期清理服务器上的用户数据，确保用户信息不会长期存储在系统中。同时，系统会采用安全可靠的数据传输方式，防止信息在传输过程中被窃取。维普查重系统的隐私保护措施全面而严谨，为用户提供了可靠的服务保障。